Evidence for a mouse origin of the SARS-CoV-2 Omicron variant
Pruebas del origen en ratones de la variante Omicron del SARS-CoV-2
This article is a preprint and has not been certified by peer review
La rápida acumulación de mutaciones en la variante Omicron del SARS-CoV-2, que permitió su brote, plantea dudas sobre si su origen próximo se produjo en los humanos o en otro huésped mamífero. Aquí identificamos 45 mutaciones puntuales que Omicron adquirió desde la divergencia del linaje B.1.1. Encontramos que la secuencia de la proteína Omicron fue sometida a una selección positiva más fuerte que la de cualquier variante del SARS-CoV-2 conocida por evolucionar persistentemente en huéspedes humanos, lo que sugiere la posibilidad de un salto de huésped. El espectro molecular (es decir, la frecuencia relativa de los doce tipos de sustituciones de bases) de las mutaciones adquiridas por el progenitor de Omicron fue significativamente diferente del espectro de los virus que evolucionaron en pacientes humanos, pero fue altamente consistente con los espectros asociados a la evolución en un entorno celular de ratón. Además, las mutaciones en la proteína de espiga de Omicron se solaparon significativamente con las mutaciones del SARS-CoV-2 que se sabe que promueven la adaptación a los huéspedes de los ratones, en particular a través de una mayor afinidad de unión de la proteína de espiga al receptor de entrada celular de los ratones. En conjunto, nuestros resultados sugieren que el progenitor de Omicron saltó de los humanos a los ratones, acumuló rápidamente las mutaciones que favorecen la infección de ese huésped y luego volvió a saltar a los humanos, lo que indica una trayectoria evolutiva interespecífica para el brote de Omicron.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.14.472632v1
HKUMed descubre que Omicron SARS-CoV-2 puede infectar más rápido y mejor que Delta en el bronquio humano pero con una infección menos grave en el pulmón
HKUMed finds Omicron SARS-CoV-2 can infect faster and better than Delta in human bronchus but with less severe infection in lung
Un estudio dirigido por investigadores de la Facultad de Medicina LKS de la Universidad de Hong Kong (HKUMed) proporciona la primera información sobre cómo la nueva variante preocupante (VOC) del SARS-CoV-2, el SARS-CoV-2 Omicron, infecta las vías respiratorias humanas. Los investigadores descubrieron que el SARS-CoV-2 Omicron infecta y se multiplica 70 veces más rápido que la variante Delta y el SARS-CoV-2 original en los bronquios humanos, lo que puede explicar por qué Omicron puede transmitirse más rápido entre los humanos que las variantes anteriores. Su estudio también demostró que la infección de Omicron en el pulmón es significativamente menor que la del SARS-CoV-2 original, lo que puede ser un indicador de una menor gravedad de la enfermedad. Esta investigación se encuentra actualmente en fase de revisión por pares para su publicación.
Resultados de la investigación
El Dr. Michael Chan Chi-wai, profesor asociado de la Escuela de Salud Pública e investigador principal del Centro de Inmunología e Infección (C2i) del Parque Científico y Tecnológico de Hong Kong (HKSTP), y el profesor John Nicholls, catedrático del Departamento de Patología del HKUMed, han sido pioneros en el uso de cultivos ex vivo del tracto respiratorio para investigar muchas infecciones víricas emergentes desde 2007, como la gripe aviar y el coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS). Ahora esta técnica se ha aplicado para entender por qué la variante Omicron puede diferir en la transmisión y la gravedad de la enfermedad de otras variantes del SARS-CoV-2.
Este método utiliza tejido pulmonar extraído para el tratamiento del pulmón, que normalmente se desecha, para investigar las enfermedades víricas del tracto respiratorio. El Dr. Chan y su equipo aislaron con éxito la variante Omicron del SARS-CoV-2 y utilizaron este modelo experimental para comparar la infección con el SARS-CoV-2 original de 2020, la variante Delta y la reciente variante Omicron. Descubrieron que la nueva variante Omicron se replica más rápidamente que el virus SARS-CoV-2 original y la variante Delta en el bronquio humano. A las 24 horas de la infección, la variante Omicron se replicaba unas 70 veces más que la variante Delta y el virus SARS-CoV-2 original. En cambio, la variante Omicron se replicó con menos eficacia (más de 10 veces menos) en el tejido pulmonar humano que el virus SARS-CoV-2 original, lo que puede sugerir una menor gravedad de la enfermedad.
Es importante señalar que la gravedad de la enfermedad en los seres humanos no está determinada únicamente por la replicación del virus, sino también por la respuesta inmunitaria del huésped a la infección, que puede dar lugar a una desregulación del sistema inmunitario innato, es decir, a una "tormenta de citoquinas"", señaló la Dra. Chan. 'También se ha observado que, al infectar a muchas más personas, un virus muy infeccioso puede causar una enfermedad más grave y la muerte aunque el propio virus sea menos patógeno. Por lo tanto, junto con nuestros recientes estudios que demuestran que la variante Omicron puede escapar parcialmente a la inmunidad de las vacunas y a la infección anterior, es probable que la amenaza global de la variante Omicron sea muy importante'.
15 December 2021
A study led by researchers from the LKS Faculty of Medicine at The University of Hong Kong (HKUMed) provides the first information on how the novel Variant of Concern (VOC) of SARS-CoV-2, the Omicron SARS-CoV-2 infect human respiratory tract. The researchers found that Omicron SARS-CoV-2 infects and multiplies 70 times faster than the Delta variant and original SARS-CoV-2 in human bronchus, which may explain why Omicron may transmit faster between humans than previous variants. Their study also showed that the Omicron infection in the lung is significantly lower than the original SARS-CoV-2, which may be an indicator of lower disease severity. This research is currently under peer review for publication.
Research findings
Dr Michael Chan Chi-wai, Associate Professor of School of Public Health and Principal Investigator, Centre for Immunology and Infection (C2i), Hong Kong Science and Technology Park (HKSTP) and Professor John Nicholls, Professor of Department of Pathology, HKUMed have pioneered the use of ex vivo cultures of the respiratory tract for investigating many emerging virus infections since 2007, such as avian influenza, coronavirus of the Middle East Respiratory Syndrome (MERS). Now this technique has been applied to understand why the Omicron variant may differ in transmission and disease severity from other SARS-CoV-2 variants.
This method uses lung tissue removed for treatment of the lung, which is normally discarded, for investigating virus diseases of the respiratory tract. Dr Chan and his team successfully isolated the Omicron SARS-CoV-2 variant and used this experimental model to compare infection with the original SARS-CoV-2 from 2020, the Delta variant and the recent Omicron variant. They found that the novel Omicron variant replicates faster than the original SARS-CoV-2 virus and Delta variant in the human bronchus. At 24 hours after infection, the Omicron variant replicated around 70 times higher than the Delta variant and the original SARS-CoV-2 virus. In contrast, the Omicron variant replicated less efficiently (more than 10 times lower) in the human lung tissue than the original SARS-CoV-2 virus, which may suggest lower severity of disease.
‘It is important to note that the severity of disease in humans is not determined only by virus replication but also by the host immune response to the infection, which may lead to dysregulation of the innate immune system, i.e. “cytokine storm”,’ said Dr Chan. ‘It is also noted that, by infecting many more people, a very infectious virus may cause more severe disease and death even though the virus itself may be less pathogenic. Therefore, taken together with our recent studies showing that the Omicron variant can partially escape immunity from vaccines and past infection, the overall threat from Omicron variant is likely to be very significant.’
About the research team
The research was conducted by a team led by Dr Michael Chan Chi-wai, Associate Professor, School of Public Health, HKUMed and Principal Investigator, C2i, HKSTP. The research team included Dr Kenrie Hui Pui-yan, Assistant Professor; Professor Malik Peiris, Tam Wah-Ching Professor in Medical Science and Chair Professor of Virology, Professor Leo Poon Lit-man, School of Public Health, HKUMed; and Professor John Nicholls, Clinical Professor, Department of Pathology, HKUMed.
https://www.med.hku.hk/en/news/press/20211215-omicron-sars-cov-2-infection?utm_medium=social&utm_source=twitter&utm_campaign=press_releasehttps://articulosclaves.blogspot.com/2021/12/senales-mixtas-ante-senales-mixtas-hay.html
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