Firma de las células T CD8+ de memoria de larga duración en la infección aguda por SARS-CoV-2 https://www.nature.com/articles/s41586-021-04280-x...

Revelamos que una firma de interferón marca los clones que dan lugar a células de larga vida, mientras que la proliferación prolongada y la señalización de la diana de rapamicina de mamíferos (mTOR) se asocian con la desaparición clonal de la sangre. En conjunto, describimos una firma transcripcional que marca las células T CD8+ humanas de memoria de larga duración que circulan tras una infección vírica aguda.

La memoria inmunológica es un rasgo distintivo de la inmunidad adaptativa y facilita una respuesta inmunitaria acelerada y mejorada en caso de reinfección con el mismo patógeno1,2. Desde el estallido de la actual pandemia de la enfermedad por coronavirus 19 (COVID-19), una cuestión clave se ha centrado en qué células T específicas del síndrome respiratorio agudo severo 2 (SARS-CoV-2) estimuladas durante la infección aguda dan lugar a células T de memoria de larga duración-- Utilizando la citometría de flujo espectral combinada con la indexación celular de los transcriptomas y la secuenciación de los receptores de células T (TCR), caracterizamos longitudinalmente las células T CD8+ específicas del SARS-CoV-2 de los pacientes de COVID-19 desde la infección aguda hasta un año después de la recuperación y encontramos una firma distintiva que identifica las células T CD8+ de memoria de larga duración. Las células T CD8+ de memoria específicas del SARS-CoV-2 que persisten un año después de la infección aguda expresan CD45RA, el receptor α de la interleucina-7 (CD127) y el factor de células T-1 (TCF1), pero mantienen un nivel bajo de CCR7, por lo que se asemejan a las células T efectoras de memoria (TEMRA) CD45RA+. Al rastrear clones individuales de células T CD8+ específicas del SARS-CoV-2, revelamos que una firma de interferón marca los clones que dan lugar a células de larga vida, mientras que la proliferación prolongada y la señalización de la diana de rapamicina de mamíferos (mTOR) se asocian con la desaparición clonal de la sangre. En conjunto, describimos una firma transcripcional que marca las células T CD8+ humanas de memoria de larga duración que circulan tras una infección vírica aguda.

Signature of long-lived memory CD8⁺ T cells in acute SARS-CoV-2 infection

Nature (2021)Cite this article

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Abstract

Immunological memory is a hallmark of adaptive immunity and facilitates an accelerated and enhanced immune response upon re-infection with the same pathogen^1,2. Since the outbreak of the ongoing coronavirus disease 19 (COVID-19) pandemic, a key question has focused on which severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)-specific T cells stimulated during acute infection give rise to long-lived memory T cells³. Using spectral flow cytometry combined with cellular indexing of transcriptomes and T cell receptor (TCR) sequencing we longitudinally characterize individual SARS-CoV-2-specific CD8⁺ T cells of COVID-19 patients from acute infection to one year into recovery and find a distinct signature identifying long-lived memory CD8⁺ T cells. SARS-CoV-2-specific memory CD8⁺ T cells persisting one year after acute infection express CD45RA, interleukin-7 receptor α (CD127), and T cell factor-1 (TCF1), but they maintain low CCR7, thus resembling CD45RA⁺ effector-memory T (T_EMRA) cells. Tracking individual clones of SARS-CoV-2-specific CD8⁺ T cells, we reveal that an interferon signature marks clones giving rise to long-lived cells, whereas prolonged proliferation and mammalian target of rapamycin (mTOR) signaling are associated with clonal disappearance from the blood. Collectively, we describe a transcriptional signature that marks long-lived, circulating human memory CD8⁺ T cells following an acute virus infection.

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Affiliations

Department of Immunology, University Hospital Zurich, Schmelzbergstrasse 26, 8091, Zurich, Switzerland
Sarah Adamo, Yves Zurbuchen, Carlo Cervia, Patrick Taeschler, Miro E. Raeber, Jakob Nilsson & Onur Boyman
Department of Biosystems Science and Engineering, ETH Zurich, Mattenstrasse 26, 4058, Basel, Switzerland
Jan Michler, Simona Baghai Sain & Andreas E. Moor
Faculty of Medicine, University of Zurich, Ramistrasse 71, 8006, Zurich, Switzerland
Onur Boyman

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Adamo, S., Michler, J., Zurbuchen, Y. et al. Signature of long-lived memory CD8⁺ T cells in acute SARS-CoV-2 infection. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04280-x