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lunes, 9 de marzo de 2020

Bioestadistica-Econometria Graficas Virus


De Vicente Rios:
 He estimado y simulado un modelo epidemiológico GGM mediante el estimador y códigos de Matlab desarrollados por Chowell (2017) con los datos del 19 feb al 4 de marzo para España, que es el día en el que hice el post anterior
 (ver el paper https://www.sciencedirect.com/…/arti…/pii/S2468042717300234…)
Con la información que había disponible en ese momento una predicción fuera de muestra basada en este tipo de modelo muy state of the art (trayectoria roja) ya mostraba que a día de hoy ibamos a estar como mínimo con 600 casos y como máximo con 1200. De hecho, el modelo predecía un aumento superior al observado (trayectoria roja vs círculos azules) y en todos los períodos siguientes, del 05mar-08mar, la trayectoria observada ha estado dentro de las bandas de confianza (lineas rojas discontinuas). 

Vicente Rios
Universidad deNavarra



El contagio crece al 45% diario en promedio. Los datos que nos indican desde el gobierno, 10.000 son bajos, en menos de una semana, 20mil. Estos son los escenarios centrales para el 18/03 en función de la muestra temporal con la que estimes la trayectoria:
Del 21febrero al 9 de marzo: 26031
Del 21febrero al 10 de marzo:28800
Del 21febrero al 11 de marzo:22529
Del 21febrero al 12 de marzo:20735
Del 21febrero al 13 de marzo:34095

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Intervalo (20.700-34.000) No actualizado, con datos de la grafica desde el 19-2-2020

- Se ve que en promedio se multiplica x2 cada dos días y x10 cada 5 días. Y las primeras medidas no se tomaron hasta el 9 por lo que podemos esperar que estos patrones se mantengan casi seguro durante la próxima semana ya que hay un desfase de 4-6 días entre los casos reportados y el momento en el que se hace el test. El factor contagio se deduce de las tasas de crecimiento o de los parámetros que capturan el crecimiento en un modelo de difusión epidemiológico. No está fijo ni es como una especie de constante universal. Según el país y el momento de tiempo en el que analices los contagiados el R0 puede ser de 0.5, 1, 10, 20...
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Datos proporcionados por Vicente Rios.

The effect of travel restrictions on the spread of the 2019 novel coronavirus (COVID-19) outbreak

Science  06 Mar 2020:
eaba9757
DOI: 10.1126/science.aba9757




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.La clave es la concentración de los casos graves. Hay que verlo casi día a día.



Gripe VS Covid-19



Complexity Explorer ( Santa Fe Institute) ver el seguimiento que hace InfoMullet sobre el "corona-virus" Covid19 (http://infomullet.com/2020/03/10/infomullet-covid-curiosity-is-a-country-facing-outbreak-or-containment /) con datos de la OMS.
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- Mientras en China la evolución, desde el primer día con algún caso ,sigue un crecimiento logístico "de libro" ,en la inmensa mayoría de los países, se pase por un cierto periodo de meseta, de entre 15 a 20 días, antes de dispararse el crecimiento del contagio de forma algo más acelerada de lo esperado. Muy pocos países ( Suiza y algún otro que no muestro y el conocido de Irán) no presentan esta anomalía "mesetaria". Presentan otra peor crecen "casi verticalmente" desde el principio. via del muro de Ignacio Martinez Lejarza Esparducer
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Hay que mirar las graficas casi cada dia para ver la evolución en cada pais, para poder ver las difencias, porque parece ser que este virus se expande de diferente forma en cada pais.


C40Ud : 

Estas crisis inesperadas que tienen un solo motivo muy claro, con una posible duración delimitada ,suelen tener  forma de U, ahora una fuerte caída para después recuperar todo lo perdido. Este escenario puede suceder que se repita en pocos dias en España, el caso de Italia, decir ahora en España, cuanto tiempo durara es precipitado,  hay muchas posibilidades que dure entre 20 y 40 dias,depende de si las medidas son drasticas o no, si hay confinamiento parcial o confinamiento total 15 dias.. 

 En cuanto China empiece a producir, como antes, se va a disparar todo. Hay mucha rotura de stocks y mucha demanda retenida. Seria una crisis en V.

Pero si afecta a la locmomotora de EEUU, es posible una crisis en U, 90 dias.

 

Genomic epidemiology of novel coronavirus (hCoV-19)



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