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domingo, 29 de marzo de 2020

Bioinformatica-Bioestadistica.-Virus Breve resumen

 Bioinformatica-Bioestadistica.-Virus Breve resumen

El virus no es un organismo vivo, sino una molecula de proteina (ADN) cubierta por una capa protectora de lipido (grasa), que al ser absorbida por las celulas de las mucosas ocular, nasal o bucal, cambian el codigo genetico de ellas (mutacion) y las convierten en celulas agresoras y multiplicadoras.
* Como el virus no es un organismo vivo sino una molecula de proteina, no se le mata, sino que se desintegra solo. El tiempo de desintegracion depende de la temperatura, humedad y tipo de material donde reposa.


* El virus es muy fragil, lo unico que lo protege es una capa fina externa de grasa. Por eso es que cualquier jabon o detergente es el mejor remedio, porque la espuma CORTA la GRASA (por eso es que hay que frotarse tanto por 20 segs o mas, para hacer mucha espuma). Al disolver la capa de grasa, la molecula de proteina se dispersa y desintegra sola.


El virus es natural y no ha estado manipulado. Cuando manipula un virus, manipulats su ADN y los lugares donde se hizo la manipulación se ve, es como notar las "cicatrices" de un corta y pega.

En construccion.... 








 
1. -Documentos técnicos para profesionales

Información científico-técnica información  COVID 19

Li, W., Moore, M. J., Vasilieva, N., Sui, J., Wong, S. K., Berne, M. A., ... & Choe, H. (2003). Angiotensin-converting enzyme 2 is a functional receptor for the SARS coronavirus. Nature, 426(6965), 450-454.

2.- Antivirales

2.1.- DRAKO

Comentario: Personalmente no los creo pero si creo que entender como funcionan las Caspasas es fundamental para entender que pasa con el virus. No mata el virus, matan los antícuerpos que se producen.

3.- Caspasas

Ichinohe, Takeshi, et al. "Inflammasome recognition of influenza virus is essential for adaptive immune responses." Journal of Experimental Medicine 206.1 (2009): 79-87.

Pedreira, P. R., Garcia-Prieto, E., Albaiceta, G. M., & Taboada, F. (2006). Respuesta inflamatoria y apoptosis en la lesión pulmonar aguda. Medicina intensiva, 30(6), 268-275.

4.- Influenza AA

Influenza A - Castor canadensis (American beaver)

Influenza A - Homo sapiens (human)

https://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?org_name=hsa&mapno=05164&mapscale=&show_description=hide

Comentario: Creo que el animal 0 puede ser un castor, más que un pangolin.

5-Imperial College

La BBC se hace eco de una publicación del Imperial College de Londrés que cubre las posibles estrategias a nivel sociedad de como trabajar contra el CoVID-19. En este artículo (está en español) se habla de varios posibles niveles de aislamiento de cara a mantener la difusión de la enfermedad en la medida de lo posible hasta que llegue una vacuna. La conclusión es que la supresión (que es como se está operando en España e Italia ahora mismo) es la única vía posible de contención.



6- Entrevista Doctor Bonaventura Clotet  RACC1 27/03/2020

Jefe del Servei de Malalties Infeccioses de l’Hospital Germans Trias i Pujol i director de l’Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa
https://www.rac1.cat/a-la-carta/cerca?text=bonaventura&programId=&from=&to=

https://foro.coronavirusmakers.org/index.php?p=/discussion/288/app-para-control-de-distancia-segura-social
https://foro.coronavirusmakers.org/index.php?p=/discussion/559/trazabilidad-coronavirus-antes-y-despues-gps-on-en-tu-disopositivo-movil-geofencing

http://safepaths.mit.edu/ (MIT)
https://covid-watch.org/collaborate (Standford)
https://covid-19-track.com/stats/main (covid-19 tracker)


7- Ponencia  del doctor J.M Miro
.
Ponencia realizada el pasado 17 de marzo de 2020 en la 17ª edición del PostCROI, organizada por la Fundación Lucha contra el Sida y coordinada por FLS Science - Casos mundo 300.000  diagnosticadas (90 paises en febrero)
La jornada aporta un resumen de gran calidad de las exposiciones presentadas en la 27a edición del CROI (Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections). - Dr. Josep Maria Miró 
Incubacion: Periodo medio es de 5 dias, oscila entre 2 y 14 dias 
Diagnostico: Un 80 % seran casos leves, un 10 % de los pacietes leves a severos, y de estos severos  un 15-20 % de severos a criticos. De forma muy rapida entre 7 a 14 dias. 
La carga viral es mas elevada en el momento del diagnostico, en la primera semana de los sintomas
- Después de la ponencia realizada el 17 de marzo del 2020 en la 17ª edición del PostCROI, el Dr. Josep Maria Miró vuelve a explicarnos cómo han avanzado los acontecimientos durante estas dos semanas. El Dr. Miró nos cuenta las últimas novedades sobre el SARS-CoV-2 y la COVID-19.

- En dos semanas despues hemos pasado de 300.000 a 1.000.0000 de casos, de 120 a 180 paises

-En la actualidad EEUU lidera los casos es el pais que tiene mas casos, seguido de España y de Italia (en proporcion a los habitantes ahora es España,166.000, con 62.000 altas)  
-La Mortalidad global es del 5 %, en España e Italia el 10 %,Es intersante con Alemania con 80.000 con una mortalidad muy baja de 1,2 % 
-
- Estudio New England -Transmisión por gotas, de 1 a 2 metros, los investigadores publicaron estudio puede persistir unas horas en el aire y varios dias en superfies, por esta cuestión del tema de aerosoles los sanitarios deben protegerse bien con el material adecuado.
-Los antivirales hay que darlos pronto
 -Los datos actuales indican que en los pacientes criticos la mortalidad es del 50 %

-Nos explica  las novedades, indica que se han realizado 250 estudios en marcha, con 157 ensayos clinicos (redesivir, colorofila,la hydroxycholoquine, y acitominicina,rendisivir,etc)
-Posible reactivacion de la hepatitis C en tratamientos largos
-En la actualidad hay 30 estudios con vacunas
 **Actualización sobre la situación de la COVID-19 | Dr. Josep Maria Miró - 03/abril/2020

Cómo PROTEGERSE del CORONAVIRUS SARS-Cov-2 (Covid-19)

  • https://www.youtube.com/watch?v=p8xYmZbEtJI

 

MODELIZACIÓN EPIDEMIOLÓGICA DEL COVID-19
- https://covid19.webs.upv.es/
 

Social Distancing to Slow the Coronavirus
-https://towardsdatascience.com/social-distancing-to-slow-the-coronavirus-768292f04296
DATOS ESPAÑA POR COMUNIDADES COVID-19
 - https://github.com/victorvicpal/COVID19_es/blob/master/data/final_data/dataCOVID19_es.csv

DENSIDADES POBLACIÓN, COMUNIDADES AUTÓNOMAS, covid19- ALTAS, MASCARILLAS,EDAD
https://github.com/datadista/datasets/tree/master/COVID%2019

INFORMES COVID Mujeres/hombres/edades/enfermedades
https://www.isciii.es/QueHacemos/Servicios/VigilanciaSaludPublicaRENAVE/EnfermedadesTransmisibles/Paginas/InformesCOVID-19.aspx

-DATOS MUNDIALES

DENSIDADES DE POBLACIÓN, Y DATOS COVID19 JSON aCTUALIZADOS
https://github.com/JoseCarlosGarcia95/covid-api-datasource/tree/master/data

DATOS COMPILADOS POR LA UNIVERSIDAD  Johns Hopkins University CenteR
https://data.humdata.org/dataset/novel-coronavirus-2019-ncov-cases

DENSIDADES DE POBLACIÓN
https://worldpopulationreview.com/countries/

Bibliografia

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