Analisis caso SudAfrica .Tulio de Oliveira
The BA.1, BA.2, and BA.3 were originally identified in southern Africa - the BA.2 and BA.3 share many not all of the characteristic mutations of BA.1/Omicron and both having many unique mutations of their own
We are currently characterizing the biological characteristics of the sub-lineages BA.1.1 and BA.2. Luckily, we already have solid results on BA.1.1. neutralization as this was the virus outgrown by@sigallabin their recent Nature paper
Omicron extensively but incompletely escapes Pfizer BNT162b2 neutralization
The emergence of Omicron (Pango lineage B.1.1.529), first identified in Botswana and South Africa, may compromise vaccine effectiveness and lead to re-infections1. We investigated whether Omicron escapes antibody neutralization in South Africans vaccinated with Pfizer BNT162b2. We also investigated if Omicron requires the ACE2 receptor to infect cells. We isolated and sequence confirmed live Omicron virus from an infected person in South Africa and compared plasma neutralization of Omicron relative to an ancestral SARS-CoV-2 strain, observing that Omicron still required ACE2 to infect. For neutralization, blood samples were taken soon after vaccination from participants who were vaccinated and previously infected or vaccinated with no evidence of previous infection. Neutralization of ancestral virus was much higher in infected and vaccinated versus vaccinated only participants but both groups showed a 22-fold escape from vaccine elicited neutralization by the Omicron variant. However, in the previously infected and vaccinated group, the level of residual neutralization of Omicron was similar to the level of neutralization of ancestral virus observed in the vaccination only group. These data support the notion that, provided high neutralization capacity is elicited by vaccination/boosting approaches, reasonable effectiveness against Omicron may be maintained.
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Cele, S., Jackson, L., Khoury, D.S. et al. Omicron extensively but incompletely escapes Pfizer BNT162b2 neutralization. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04387-1
We are providing an unedited version of this manuscript to give early access to its findings. Before final publication, the manuscript will undergo further editing. Please note there may be errors present which affect the content, and all legal disclaimers apply.
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There is of course a lot of work needed to better characterize BA.1.1, BA.2, and BA.3. We in South Africa, are alerted but not too concerned given the Omicron wave is decreasing fast here. Of course, we will keep advancing science and communicate as more results emerge.
https://twitter.com/Tuliodna/status/1486384952858058755
-Omicron y la incertidumbre-Agencia Sinc.es
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· El Dr. JM Miró, del Hospital Clínic de Barcelona, ofrece 45 minutos de actualización sobre Omicron, la variante del SARS-CoV-2 que está provocando millones de infecciones en todo el mundo..
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-Omicron :Resumen Grupo de Investigacion Cientifica en Salud y tecnologia
· Grupo de Investigacion Cientifica en Salud y tecnologia de Cochapamba, conformado por: investigadores, médicos especialistas, medicos generales, medicos residentes, estudiantes de medicina -Omicron ACTUALIZADO 22/12/21
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Las mutaciones del coronavirus SARS-CoV-2
Marcos López Hoyos: “La COVID seguirá mutando a una variante menos agresiva que la convertirá en un catarro”
-Omicron / Repaso al tema mutaciones
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-Coronavirus: qué se sabe de las mutaciones del virus del covid-19 (y cómo los científicos las están siguiendo en tiempo real)
-Cómo son las mutaciones en los virus y qué sabemos en el caso del SARS-CoV-2
-Coronavirus: cómo mutan los virus y cómo prevén los científicos que puede evolucionar el covid-19
La evolución es impredecible.:Si el virus consigue por ejemplo replicar más rápido o generar más progenie prescindiendo de funciones supresoras de inmunidad celular, podría haber más patogenia y más dispersión al mismo tiempo.
-El virus muta, obtiene ventaja y la naturaleza decide. Ella al azar ha decidido que Omicron es muy transmisible y menos virulento, por eso se extiende como la pólvora.
https://articulosclaves.blogspot.com/2021/12/mutaciones-virus.html
Coronavirus: qué se sabe de las mutaciones del virus del covid-19 (y cómo los científicos las están siguiendo en tiempo real)
Cómo son las mutaciones en los virus y qué sabemos en el caso del SARS-CoV-2
Habrá otra variante
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La vigilancia genómica ha sido una excelente herramienta que ha ayudado a conocer como mutaba el virus.
https://articulosclaves.blogspot.com/2022/01/habra-otra-variante-esto-es-lo-que-el.html
Variantes, casuística
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Variantes en estudio
· https://twitter.com/hashtag/Flurona?src=hashtag_click
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Estimated transmissibility and impact of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in England
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abg3055
La infección #Ómicron mejora la inmunidad neutralizante contra #Delta. Esto sugiere que Ómicron ayudará a expulsar a Delta, ya que debería disminuir la probabilidad de que alguien infectado con Omicron se vuelva a infectar con Delta
· https://articulosclaves.blogspot.com/2021/12/mutaciones-virus.html
La infección #Ómicron mejora la inmunidad neutralizante contra #Delta. Esto sugiere que Ómicron ayudará a expulsar a Delta, ya que debería disminuir la probabilidad de que alguien infectado con Omicron se vuelva a infectar con Delta
- HKUMed descubre que Omicron SARS-CoV-2 puede infectar más rápido y mejor que Delta en el bronquio humano pero con una infección menos grave en el pulmón/ Evidence for a mouse origin of the SARS-CoV-2 Omicron variant-
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Transmission of SARS-CoV-2 by children and young people in households and schools: A meta-analysis of population-based and contact-tracing studies
· https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(21)00633-2/fulltext
"Un estudio del Imperial College de Londres concluye que la inmunidad natural generada después de la infección por ómicron roza el 19% frente al 85% que proporcionaba Delta"
https://www.imperial.ac.uk/news/232698/omicron-largely-evades-immunity-from-past/
https://articulosclaves.blogspot.com/2022/01/omicron-se-transmite-con-mas-rapidez.html
-Asymptomatic transmission and high community burden of seasonal influenza in an urban and a rural community in South Africa, 2017–18 (PHIRST): a population cohort study
https://www.thelancet.com/journals/langlo/article/PIIS2214-109X(21)00141-8/fulltext
- La tercera ola y el gráfico de Victor Tseng
https://notistecnicas.blogspot.com/2022/01/la-tercera-ola-y-el-grafico-de-victor.html
-Hacia el fin de la excepcionalidad
https://notistecnicas.blogspot.com/2022/01/hacia-el-fin-de-la-excepcionalidad.html
Early assessment of the clinical severity of the SARS-CoV-2 Omicron variant in South Africa
Severity of Omicron variant of concern and vaccine effectiveness against symptomatic disease: national cohort with nested test negative design study in Scotland
Resistence of functional memory B cells recognizing SARS-CoV-2 variants despite loss of specific IgG
· https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(21)01629-
Maduración de la afinidad : las células B de memoria pueden modificar los Ac para adaptarse a las modificaciones de las variantes
Targeting memory T cell metabolism to improve immunity
· https://notistecnicas.blogspot.com/2021/12/t-cell-receptors-tcrs.html
SARS-CoV-2 spike T cell responses induced upon vaccination or infection remain robust against Omicron
· https://notistecnicas.blogspot.com/2021/12/sars-cov-2-spike-t-cell-responses.html
Maduración de la afinidad : las células B de memoria pueden modificar los Ac para adaptarse a las modificaciones de las variantes
· https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(21)01629-1
· https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.12.27.21268278v1.full.pdf
The omicron (B.1.1.529) SARS-CoV-2 variant of concern does not readily infect Syrian hamsters
· https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.24.474086v1
Firma de las células T CD8+ de memoria de larga duración en la infección aguda por SARS-CoV-2 e Interferon
· https://notistecnicas.blogspot.com/2021/12/firma-de-las-celulas-t-cd8-de-memoria.html
· https://notistecnicas.blogspot.com/2021/01/asi-funcionan-las-vacunas-de-arn.html
· https://notistecnicas.blogspot.com/2020/12/de-hungria-un-futuro-nobel-retrato-de.html
Comparison of outcomes from COVID infection in pediatric and adult patients before and after the emergence of Omicron
· https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.12.30.21268495v1
SARS-CoV-2 and influenza virus co-infection
Ómicron infecta menos las células pulmonares
· Al menos en modelos celulares y en hámsteres. Es verdad que no tenemos el dato en humanos, pero existen varios trabajos preliminares que sugieren que la variante ómicron se multiplica peor en células pulmonares, lo cual podría ser indicativo de su menor virulencia (aunque habría que comprobar qué ocurre en otros órganos).
· https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.24.474086v1
Early Remdesivir to Prevent Progression to Severe Covid-19 in Outpatients
· https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2116846?s=09
Preclinical studies demonstrate sotrovimab retains activity against the full combination of mutations in the spike protein of the Omicron SARS-CoV-2 variant
· https://www.gsk.com/en-gb/media/press-releases/sotrovimab-retains-activity/
SARS-CoV-2 entry sites are present in all structural elements of the human glossopharyngeal and vagal nerves: clinical implications
· https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.30.474580v1
Early assessment of the clinical severity of the SARS-CoV-2 Omicron variant in South Africa· https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.12.21.21268116v1?fbclid=IwAR0HPDCG_7NOhYPVgZ9HDNOM6Eae1OgoGZLYL35snjumdoCPFF9wFxU7n5g
Severity of Omicron variant of concern and vaccine effectiveness against symptomatic disease: national cohort with nested test negative design study in Scotland
Persistence of functional memory B cells recognizing SARS-CoV-2 variants despite loss of specific IgG
Maduración de la afinidad : las células B de memoria pueden modificar los Ac para adaptarse a las modificaciones de las variantes
· https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(21)01629-1
· El Paxlovid es un inhibidor de una de las proteasas del SARS-CoV-2, la denominada 3CL. El tratamiento se combina con otro inhibidor de las proteasas, el ritonavir, que ha sido empleado contra el VIH.
El anticuerpo monoclonal Sotrovimab, de la empresa GSK, también parece que es eficaz contra ómicron.
· https://www.gsk.com/en-gb/media/press-releases/sotrovimab-retains-activity/
El Remdesivir, un inhibidor de la ARN polimerasa viral, es otro antiviral que enpacientes no hospitalizados con síntomas covid-19 Hasta la fecha, la actividad antiviral de Remdesivir ha sido confirmada in vitro contra todas las otras variantes del SARS-CoV-2, incluyendo alfa, beta, gamma, delta y épsilon.
· https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2116846?s=09
Co-infection with SARS-CoV-2 and Influenza A Virus in Patient with Pneumonia, China
· https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/26/6/20-0299_article
The clinical characteristics of pneumonia patients co-infected with 2019 novel coronavirus and influenza virus in Wuhan, China
SARS-CoV-2 and influenza virus co-infection
· https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)31052-7/fulltext
Estudio danés sobre transmisión de Ómicron en vacunados más q en no vacunados
· https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.12.27.21268278v1
Análisis de Rafa Toledo
· https://notistecnicas.blogspot.com/2021/12/omicron-repaso-al-tema-mutaciones.html
· https://999plazaradio.valenciaplaza.com/omicron-coronavirus-vacunas-inmunizacion
· https://notistecnicas.blogspot.com/2022/01/febrero-sera-clave-empezaran-liberarse.html
·
Viral dynamics and duration of PCR positivity of the SARS-CoV-2 Omicron variant
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.01.13.22269257v1
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.01.10.22269010v2.full.pdf
Se inicia en ensayo clínico para analizar la
eficacia y seguridad de una vacuna de Pfizer/BioNTech diseñada específicamente
contra la variante ómicron del SARS-CoV-2
Interferon
· https://notistecnicas.blogspot.com/2021/06/interferon-resistance-of-emerging-sars.html
https://notistecnicas.blogspot.com/2022/01/omicron-e-interferon.html
Interferon y otros farmacos que se utilizan en el virus de la hepatitis C (fibrosis higado) - En estudio, relación interferon con coronavirus -Marzo 2020
La combinación de tres antivirales ( interferón beta-1b más lopinavir-ritonavir y ribavirina) se muestra prometedora para tratar la Covid-19 -Mayo 2020
Resistencia al interferón de las variantes emergentes del SARS-CoV-2 -Junio 2021
Hepa C -Interferon y
relación con fibrosis pulmonar
https://notistecnicas.blogspot.com/2020/03/murcielagos-vs-interferon-medicacion.html
https://notistecnicas.blogspot.com/2020/03/en-estudio-relacion-interferon-con.html
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Antivirales
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Vacunas
Vacunados versus no vacunados-Morbidity and Mortality Weekly Report (MMWR)
https://notistecnicas.blogspot.com/2022/01/vacunados-versus-no-vacunados-morbidity.html
Eficacia Vacunas
· https://articulosclaves.blogspot.com/2022/01/las-vacunas-inmunizan.html
https://notistecnicas.blogspot.com/2021/07/el-concepto-de-eficacia-en-las-vacunas.html
·Vacunados/No vacunados
· https://articulosclaves.blogspot.com/2021/12/vacunados-no-vacunados-ny-mayo.html
Las vacunas inmunizan es un hecho incuestionable.
· https://twitter.com/alfwarrior/status/1403313688623435782
· https://twitter.com/alfwarrior/status/1476452714997506050
· https://articulosclaves.blogspot.com/2022/01/las-vacunas-inmunizan.html
https://twitter.com/RanIsraeli/status/1483545718359048197
Inmunidad
· https://notistecnicas.blogspot.com/2021/07/drosten-y-la-inmunidad-de-grupo.html
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· https://notistecnicas.blogspot.com/2021/12/firma-de-las-celulas-t-cd8-de-memoria.html
· https://notistecnicas.blogspot.com/2021/12/sars-cov-2-spike-t-cell-responses.html
Darle al virus donde más le duele: los dos nuevos antivirales contra SARS-CoV-2
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· https://notistecnicas.blogspot.com/2021/12/inmunidad-de-grupo-agutierrez.html
El débil ataque de Omicron a los pulmones podría hacerlo menos peligroso.
Omicron’s feeble attack on the lungs could make it less dangerous
· Mounting evidence from animal studies suggests that Omicron does not multiply readily in lung tissue, which can be badly damaged in people infected with other variants.
· https://www.nature.com/articles/d41586-022-00007-8
·The novel coronavirus originating in Wuhan, China: challenges for global health governance.
Coronavirus disease 2019 (COVID-19) situation report—100.
La evolución de las vacunas: de Edward Jenner a Katalin Karikó
En este documental de Eduard Punset se explica como se conocía la peligrosidad de los coronavirus SARS y como en cualquier momento podría aparecer un virus como el que padecemos actualmente.
https://www.youtube.com/watch?v=7PHTix2AFEg
Redes
https://www.youtube.com/watch?v=xz_M-TRJGgk
El retorno de las epidemias
https://www.youtube.com/watch?v=a3-mIeOJnbU
Bioquimica
https://www.youtube.com/watch?v=DDXY1ig1v68
La tendencia general
https://articulosclaves.blogspot.com/2022/01/la-tendencia-general-lopez-acunala.html
Ver gráficos análisis Sudáfrica y otros países (11-2021 y 12-2021)
https://articulosclaves.blogspot.com/2022/01/vacunacion-o-restriccionesel-debate.html
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https://articulosclaves.blogspot.com/2022/01/analizando-sudafrica-y-ahora-uk-verian.html
Visión estática de la pandemia
https://articulosclaves.blogspot.com/2022/01/vision-estatica-de-la-pandemia-y-seguir.html
La tendencia general…
https://articulosclaves.blogspot.com/2022/01/la-tendencia-general-lopez-acunala.html
Covid-19 en España durante 2021
Boscá, J. E., J. Cano y J. Ferri (2022). “Covid-19 en España durante 2021.” FEDEA, Documento de Trabajo no. 2022-01. Madrid.
https://policy.fedea.net/covid-19-en-espana-durante-2021/
https://es.scribd.com/document/554801455/covid#download&from_embed
Resumen pandemia 13-1-2022
· https://articulosclaves.blogspot.com/2022/01/rsumen-de-la-pandemia-13-enero-2022.html
Enlaces anteriores 9-1-2022
https://notistecnicas.blogspot.com/2022/01/enlaces-coronavirusmutaciones.html
https://notistecnicas.blogspot.com/2022/01/ii-enlaces-fuentes-sobre-el-virus.html
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