The Origins of SARS-CoV-2: A Critical Review

Los orígenes del SARS-CoV-2: una revisión crítica

Holmes, Edward C; Goldstein, Stephen A; Rasmussen, Angela L; Robertson, David L; Crits-Christoph, Alexander; Wertheim, Joel O; Anthony, Simon J; Barclay, Wendy S; Boni, Maciej F; Doherty, Peter C; Farrar, Jeremy; Geoghegan, Jemma L; Jiang, Xiaowei; Leibowitz, Julian L; Neil, Stuart J D; Skern, Tim; Weiss, Susan R; Worobey, Michael; Andersen, Kristian G; Garry, Robert F; Rambaut, Andrew

Los orígenes del SARS-CoV-2: una revisión crítica

Holmes et al.

Desde los primeros informes de un nuevo coronavirus similar al SARS en diciembre de 2019 en Wuhan, China, ha habido un intenso interés en entender cómo el SARS-CoV-2 surgió en la población humana. El debate reciente ha girado en torno a dos ideas contrapuestas: un escenario de "escape de laboratorio" y la emergencia zoonótica. En este artículo se revisan críticamente las pruebas científicas actuales que pueden ayudar a aclarar el origen del SARS-CoV-2

https://zenodo.org/record/5075888#.YOaRZ0ztbIU

Coronavirus son conocidos desde hace mucho tiempo por presentar riesgos pandémicos.

SARS-CoV-2 es el noveno coronavirus coronavirus documentado que infecta a los humanos y el séptimo identificado en los últimos 20 años .

Todos los coronavirus humanos anteriores tienen un origen zoonótico, al igual que la gran mayoría de los virus humanos. La aparición del SARS -CoV -2 presenta varias características de estos eventos zoonóticos anteriores.

Muestra claras similitudes con el SARS -CoV que se extendió a los humanos en Foshan, provincia de Guangdong provincia de Guangdong, China, en noviembre de 2002, y de nuevo en Guangzhou, provincia de Guangdong, en 2003 -.

Ambos casos de SARS - CoV se asociaron a mercados de venta de animales vivos y afectaron a especies especies involucradas, particularmente civetas y perros mapaches,, que también se vendían vivos en los mercados de Wuhan mercados en 2019 y que se sabe que son susceptibles de contraer el SARS -CoV 2

Los comerciantes de animales trabajando en 2003, sin un diagnóstico de SARS, se documentó que tenían altos niveles de IgG al SARS -CoV (13% en general y >50% para los comerciantes especializados en civetas . La serología posterior ogical de positividad al SARS de ~3%. - CoV (SARSr - CoV) en los residentes de la provincia de provincia de Yunnan que viven cerca de las cuevas de murciélagos demostrando una exposición regular en lugares rurales.

Los parientes más conocidos de ambos virus del SARS - CoV y SARS-CoV-2 son virus procedentes de murciélagos de Yunnan, aunque se han muestreado preferentemente animales de esta provincia. Tanto para el SARS CoV y SARS -CoV -2, hay una diferencia geográfica considerable entre Yunnan y la localidad de los primeros casos humanos , lo que pone de manifiesto la dificultad de identificar la vía exacta de de la emergencia del virus y la importancia del muestreo más allá de Yunnan.

Tenemos en primer lugar un análisis espacio-temporal de los primeros casos y un análisis filogenético de las primeras secuencias disponibles

En el análisis filogenético vemos dos linajes claramente diferenciados ya en las primeras semanas. Eso es difícil de explicar por escape de laboratorio, y más bien apunta a más de un evento de "spillover" de animal a humano (zoonosis 1:escape 0).

El análisis espacio-temporal destaca que el surgimiento de casos se agrupa en torno a los mercados "húmedos" y no al laboratorio del WIV. (zoonosis 2:escape 0)

Ninguno de los 3 coronavirus conocidos más similares al SARS-CoV2 han estado nunca en el WIV. El RaTG13 (menos cercano) si, pero no es su ancestro, ni natural ni artificialmente(zoonosis 3: escape 0)

El "gap" genético (4%) entre los CoVs más similares al SARS-CoV2 es normal, pues las "formas de transición" que pudieran haber dado lugar a éste normalmente tendrían poco éxito evolutivo y desaparecerían. De hecho, para otros muchos virus esas formas son también desconocidas.

Si bien hay incidentes en laboratorios que han podido dar lugar a brotes de enfermedad, siempre han sido asociados a virus conocidos, en trabajos sostenidos en el tiempo con cultivos altamente concentrados, algo que no sucedía en el WIV con ningún virus parecido al SARS-CoV2.

El riesgo de escape asociado a la secuenciación de muestras víricas (la mayor parte del trabajo del WIV en este tipo de virus era de esa naturaleza) es negligible ya que las muestras se inactivan previamente a analizarlas (zoonosis 4: escape 0).

Los datos de seguimiento clínico, analítico y epidemiológico del personal del WIV (incluyendo el del equipo de la Dra Zheng-Li) descartan que hubiera ninguna infección por virus relacionados con el SARS-Cov2 antes de diciembre de 2019

No hay rastro en el WIV de actividad alguna de experimentos de "ganancia de función" con virus similares al SARS-CoV2, que en aislamiento convencional pierden un sitio clave, lo que obliga a desarrollar genética reversa, de lo cual tampoco hay rastro...

No solo no hay rastro, sino que tampoco hay lógica alguna: de hacer ese tipo de experimentos, no se emplearía un virus desconocido hasta el momento, precisamente por carecerse de conocimientos básicos sobre él (zoonosis 5: escape 0).

Suponiendo un escape de cualquier tipo, antes de diciembre de 2019 no tendría sentido haber ocultado estas investigaciones

Es imposible que el virus surgiera de experimentos in vivo con roedores: el virus ha de adaptarse para ello mutando la posición N501Y. Esta mutación se ha producido en numerosas variantes durante la pandemia, pero no estaba presente al principio

Durante la pandemia el virus ha ido "afinando" su dominio de unión al receptor ACE-2 mediante mutaciones, así que lo de que está "manipulado" para "humanizarlo" va a ser que no (zoonosis 6: escape 0)

Además, SARS-CoV2 es bastante "generalista", ya que es capaz de infectar no solo a humanos, sino a un buen número de especies de mamíferos, con lo cual eso de que esta "pre" adaptado a humanos no tiene ningún sentido (zoonosis 7: escape 0)

Lo del sitio de procesamiento por furina tampoco es nada del otro mundo ya que multitud de coronavirus lo portan. Por lo tanto es perfectamente natural y evolutivamente comprensible que SARS-CoV2 lo lleve también

Además, el sitio de procesamiento por furina del SARS-CoV2 es de un diseño más bien pobre comparado con otros sitios análogos en otros coronavirus. Es poco realista pensar que ese pobre diseño obedezca a una manipulación artificial con una finalidad concreta

Por todo lo anterior, la explicación más plausible es el origen zoonótico del virus, que gana por goleada a la alternativa del escape, que de hecho, cuenta con 0 ("cero") evidencias en su favor

Miguel Ángel Jiménez Clavero, virólogo y Profesor de Investigación en el CISA (@INIA_es). Autor del blog: Virus emergentes y cambio global

https://twitter.com/Virusemergentes

http://www.madrimasd.org/blogs/virusemergentes/

SARS-CoV-2: De cerca

Proteína en forma de espiga, clave para el desarrollo de la vacuna

El material con el plan genético del SARS-CoV-2 se llama ARN (espirales amarillas). La información del ARN especifica los aminoácidos que forman las proteínas que son las piezas reales de la partícula del virus.

El ARN está protegido en la envoltura del virus (anillo exterior negro) hasta que encuentra una potencial célula hospedadora. La envoltura está compuesta de varias proteínas, entre ellas, la proteína de la envoltura (espigas azules), la proteína de la membrana (espigas amarillas) y la glicoproteína de la espícula o proteína en forma de espiga (espiga roja y alta).

La glicoproteína de la espícula ayuda a que el virus se prenda y entre a la célula hospedadora para infectarla.

Fuentes: Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas; Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades

https://magazine.medlineplus.gov/es/art%C3%ADculo/sars-cov-2-de-cerca/

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