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viernes, 18 de junio de 2021

Mutaciones....vs Antivirales

 

 

Mutaciones....vs Antivirales

 
Ante la pregunta.¿la variante británica, africana, brasileña etc también fue una creación y escape de algún laboratorio?  ver como se producen las mutaciones
 
Debate:
 
Algo que habréis leído últimamente, sobre una supuesta prueba de que el SARS-CoV-2 haya sido manipulado, en base a un ensayo de S. Quay y R. Muller en el WSJ. Se apoyan en que la secuencia CGGCGG no aparece naturalmente en coronavirus. ¿Es cierto?
 
Codon Pair Bias (CPB) es un concepto se basa en el hecho de que el código genético está degenerado (WHAT)
Varios codones (los grupos de tres letras CGG o UAC) llevan la información para un aminoácido (para formar proteínas). Pero varios codones pueden codificar para el mismo aminoácido. Por ejemplo, para la arginina, puede ser CGG, CGU, CGA...y no todos son igual de frecuentes.
Esto significa que algunos tenderán a aparecer más que otros. Y luego además, que aparezcan seguidos, también será más o menos frecuente según el organismo y disponibilidad en el ambiente celular. Por ello, los virus, por propia evolución y selección, tiran más hacia unos codones
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En este ensayo, se basan en que en coronavirus, que aparezcan dos argininas seguidas codificadas por CGG es raro o imposible y que solo se puede haber dado por manipulación. 
Aquí aparece la secuencia:

 
 
 De algún modo, establecen la teoría de que esta pareja de codones seguidos, dotan de una mayor virulencia o letalidad al virus, y que se ha modificado por gain of function sin dejar rastro (pero sin demostrar cómo).
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La verdad, es que aunque sea improbable, no es imposible de forma natural. Cualquier virus (sobre todo los coronavirus) sometido a presión selectiva, puede aparecer con ese Codon Pair Bias y seleccionarse de forma natural. Hay algo importante a tener en cuenta aquí
Y es que en coronavirus, cuantos más pases (pasar de un hospedador a otro, ya sea in vitro o in vivo) más posibilidades hay de mutación y adaptación. Pero, ¿en qué me baso para decir esto? Pues en que yo ya había visto esta secuencia antes. En otro coronavirus.
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Se trata del coronavirus PEDV, que utilicé como uno de los modelos para estudiar la recombinación. En este coronavirus animal, ya se observó esta secuencia "rarísima" en cepas CH/FJND-3/2011 y AJ1102. Este coronavirus surgió en el 78, no es nuevo.
 

Después de circular (y causar epidemias en medio mundo) durante años surgieron cepas con este cambio selectivo. Fueron aislados de ganado porcino. ¿Os parece poca prueba de que no se ha manipulado sino que aparece porque son virus chinos? ALRIGHT  
 
Curiosamente, esta secuencia "rarísima" también aparece en una cepa de este coronavirus en ARANDA DE DUERO (Burgos). ¿Creéis que en Burgos se dedican a crear armas biológicas aparte de hacer quesos? NO. Es por presión selectiva y cambio de hospedador y de frecuencia de CPB.
 
 

  En la tesis de Alex, pudo ver cómo afecta este cambio de frecuencia a la viabilidad y virulencia del virus, pero es completamente aleatorio y no sigue ningún patrón. Y por supuesto, para realizar este cambio bien, deben ser mutaciones SILENCIOSAS

 
Alex Baggins, PhD
Doctor en Bioquímica, biología molecular y biomedicina. Estudiante de medicina. Tesis doctoral en coronavirus. Cofundador y COO de @labvisor_site   
 
Es la respuesta de Alex Baggins a este articulo que no se lo cree:

The Science Suggests a Wuhan Lab Leak

The Covid-19 pathogen has a genetic footprint that has never been observed in a natural coronavirus.
Por Steven Quay y Richard Muller
6 de junio de 2021 
 
El patógeno Covid-19 tiene una huella genética que nunca se ha observado en un coronavirus natural.

La posibilidad de que la pandemia comenzara con una fuga del Instituto de Virología de Wuhan está atrayendo una nueva atención. El presidente Biden ha pedido a la comunidad nacional de inteligencia que redoble sus esfuerzos para investigar.

Gran parte del debate público se ha centrado en pruebas circunstanciales: misteriosas enfermedades a finales de 2019; el trabajo del laboratorio sobrecargando intencionadamente los virus para aumentar su letalidad (lo que se conoce como investigación de "ganancia de función"). El Partido Comunista Chino se ha mostrado reacio a revelar información relevante. Los informes basados en la inteligencia estadounidense han sugerido que el laboratorio colaboró en proyectos con el ejército chino.

Pero la razón más convincente para favorecer la hipótesis de la fuga del laboratorio está firmemente basada en la ciencia. En particular, consideremos la huella genética del CoV-2, el nuevo coronavirus responsable de la enfermedad Covid-19.

En la investigación de ganancia de función, un microbiólogo puede aumentar enormemente la letalidad de un coronavirus empalmando una secuencia especial en su genoma en un lugar privilegiado. Esto no deja rastro de la manipulación. Pero altera la proteína de la espiga del virus, facilitando que éste inyecte material genético en la célula víctima. Desde 1992 se han realizado al menos 11 experimentos distintos añadiendo una secuencia especial en el mismo lugar. El resultado final ha sido siempre virus sobrealimentados.
 
  • https://www.wsj.com/articles/the-science-suggests-a-wuhan-lab-leak-11622995184 
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Los autores del análisis indican que es muy poco probable que SARS-CoV-2 haya sido creado a partir de la manipulación de otro coronavirus. La estructura del genoma de SARS-CoV-2 no deriva de la de otro virus, que sería lo que se esperaría si fuera de diseño.
  • https://genotipia.com/genetica_medica_news/sars-cov/?fbclid=IwAR2k3jSjMayQyz5WBpytytdNifgi7sw3x4VU5vTW0wKaUCyFeTetWA70kyY
El origen animal del SARS 2003 no se determinó hasta 14 años después de la epidemia. Y esperamos que un año después se determine y encuentre el origen del COVID?  
 
  • https://www.sciencedaily.com/releases/2017/11/171130141222.htm?fbclid=IwAR33P8Ee5ZyBm6Eq6Ekw3wW6UDwLAf5pngavVZK3jyF0ORcDrC0AE30nZhw
 

Las mutaciones del coronavirus SARS-CoV-2

Por Francisco R. Villatoro, el 7 marzo, 2020

  •  Mutaciones articulo 9 de marzo 2020, no se si hay otro mas actualizado https://notistecnicas.blogspot.com/search?q=mutaciones
  • https://notistecnicas.blogspot.com/2020/03/las-mutaciones-del-coronavirus-sars-cov.html
 

Coronavirus: cómo mutan los virus y cómo prevén los científicos que puede evolucionar el covid-19 

30-octubre 
 
  • https://notistecnicas.blogspot.com/2020/10/coronavirus-como-mutan-los-virus-y-como.html
 
-Otra duda: el medicamento de peiferz se centre en imitar el RNAm de un proteína ,y es precisamente en esa proteína donde están siendo las mutaciones.
 
-Las cepas seguirán ,la brasileña reinfectó a Manaos, que creían que habían llegado a inmunidad de rebaño. La india es más rápida de transmitir, dicen más letal, pero no es muy científico , por que con hacinamientos hay más infección y sin medios es más letal. Lo que no sé es como lo llevamos aquí, de la india salieron dos y después había dieciocho. 

Origen del virus? Qué información proporciona la secuenciación del genoma del coronavirus SARS-CoV-2-The proximal origin of SARS-CoV-2

Debate Origen del Virus

 Los autores del análisis indican que es muy poco probable que SARS-CoV-2 haya sido creado a partir de la manipulación de otro coronavirus. La estructura del genoma de SARS-CoV-2  no deriva de la de otro virus, que sería lo que se esperaría si fuera de diseño.

  • https://genotipia.com/genetica_medica_news/sars-cov/ 
  •  https://notistecnicas.blogspot.com/2021/05/que-informacion-proporciona-la.html?fbclid=IwAR1ZAN9UR9SrfRMyZpynCB43j62IjveCOWHRL5NAUBQHq3bDHdVUvWDy_4w
 
 

EUA invertirá 3200 millones de dólares para crear antivirales contra covid 

Estados Unidos invertirá 3.200 millones de dólares procedentes de su Plan de Rescate para desarrollar antivirales que sirvan para tratar la covid-19 y para futuras amenazas epidémicas.

Con este programa, que anunciaron los responsables del equipo de respuesta contra la pandemia de la Administración de Joe Biden, se pretende sumar fuerzas entre la industria y la comunidad científica para desarrollar nuevos medicamentos que combatan el coronavirus.

El principal epidemiólogo del país, Anthony Fauci, explicó en rueda de prensa que, en este momento, las vacunas son el centro del “arsenal” contra la covid-19, pero los antivirales pueden ser un complemento importante y muy necesario en el futuro.

 

Todos los expertos que hablaron en esta comparecencia subrayaron la importancia que las vacunas están teniendo para que baje la incidencia de la pandemia en el país, donde por primera vez las muertes diarias se han situado por debajo de las 300, al registrarse una media de 286 en los últimos siete días.

Así lo apuntó la directora de los Centros de Control de Enfermedades (CDC, en inglés), Rochelle Walensky, durante la rueda de prensa del equipo de respuesta COVID de la Casa Blanca, en el que se anunció el citado programa.

La estrategia antiviral funcionará bajo dos pilares -desarrollo y descubrimiento-, y pretende acelerar las pruebas clínicas de los medicamentos que se están desarrollando.

De los 3.200 millones de inversión, 500 millones se dedicarán a la investigación en laboratorio, 1.000 millones a las evaluaciones clínicas, otros 700 millones a la fabricación mediante proyectos asociados del Institutos Nacionales de Salud (NIH, en inglés) y el sector privado.

La inversión se completará con otros 1.000 millones para apoyar la creación de centros de desarrollo de medicamentos antivirales contra patógenos que puedan provocar pandemias. 

 El coordinador del equipo de respuesta de la Casa Blanca, Jeff Zients, señaló por su parte que pese a todos los progresos que se están haciendo en el país con la vacunación, muchas comunidades “siguen en riesgo” por culpa de los bajos niveles de inoculaciones, sobre todo con las variantes, que suponen una mayor amenaza.

Zients destacó los datos hasta la fecha, con 175 millones de estadounidenses que han recibido al menos una dosis, entre los que están el 87 por ciento de las personas de más de 65 años y el 74 por ciento de los que tienen más de 40.

Además subrayó la buena marcha en algunas zonas, con el 70 por ciento de los adultos con al menos una dosis en 14 estados y en el Distrito de Columbia.

Pero insistió en que las zonas con menor porcentaje de vacunación siguen teniendo muchos riesgos, y por eso el Gobierno seguirá promoviendo las inoculaciones en todos esos territorios. En este sentido, anunció que la vicepresidenta, Kamala Harris, seguirá viajando a zonas clave para animar a la vacunación.

Estados Unidos alcanzó el miércoles 33.496.627 casos confirmados de covid-19 y 600.624 fallecimientos, de acuerdo con el recuento independiente de la Universidad Johns Hopkins

  • https://www.sandiegouniontribune.com/en-espanol/noticias/salud/articulo/2021-06-17/eua-invertira-3200-millones-de-dolares-para-crear-antivirales-contra-covid?fbclid=IwAR1FcpKECURyLzIgLFB2CntxbWoGGoXCJiHJRXe99A3ekZbrJE1wxcWNn8Y

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