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Bioinformatica

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Artículos
A cartoon guide to bioinformatics by a novice coder. Nature June 2021
Big Data: Astronomical or Genomical? PLoS biology 2015
Bioinformatics: scalability, capabilities and training in the data driven era. Briefings in Bioinformatics, Volume 20, Issue 2, March 2019, Pages 735–736
Biologists frustrated with wet-lab work can find rewards in a move to computational research
Biology: The big challenges of big data. Nature volume 498, pages255–260 (2013)
Markowetz, F. (2017) All biology is computational biology. PLoS biology 2017 15:e2002050
Perkel, J.M. (2017) How bioinformatics tools are bringing genetic analysis to the masses. Nature Journal
Smith, D.R. (2018) Bringing bioinformatics to the scientific masses: As the demand for high-level bioinformatics is growing, training students in the field becomes ever more important. EMBO reports 2018 19:
Tener buenas notas ya no basta para conseguir un buen empleo. Artículo de Esther Tejedor y Víctor Barreira en el País Sep 2013
The $1,000 genome, the $100,000 analysis?
The scientist of the future 2015. (A special issue of Nature examines what is needed to grow the next generation of scientists.)
Webb, S. (2018) Deep learning for biology. Nature 2018 554:555-557
Variación genética/genómica y evolución molecular Introducción general a la bioinformática y sus herramientas Fundamentos de evolución molecular: distancias genéticas y modelos de evolución del ADN Medidas de semejanza: cálculo de matrices de sustitución (PAM/BLOSUM) Métodos de reconstrucción filogenética (UPGMA, neighbour-joining, máxima verosimilitud) Determinación de la fiabilidad del árbol filogenético: bootstrapping Duplicación génica: identificación de ortólogos y parálogos Variabilidad intraespecífica: polimorfismos de ADN y haplotipos
Genómica: ensamblaje, secuencias y anotaciones Secuencias y anotaciones Métodos de secuenciación de secuencias nucleotídicas y aminoacídicas Calidad de secuencia Aplicaciones de la secuenciación masiva (HTS): genómica, transcriptómica, epigenómica Ensamblaje de genomas, mapeo de lecturas (reads) y patrones de cobertura Detección de elementos reguladores y conformación de la cromatina por HTS Modelización y almacenamiento de los datos bioinformáticos Registros de secuencia, de coordenadas y otros formatos básicos de datos Anotación de secuencias genómicas Motivos de secuencia y modelos de señales (matrices de pesos, modelos de Markov y perfiles) Predicción computacional de genes Evaluación de la fiabilidad de los programas de predicción
Análisis de la expresión génica y comparación de secuencias Transcriptómica: microchips (microarrays) y RNA-seq Análisis de los patrones de expresión génica Anotación funcional y ontologías Comparando secuencias: dotplot Alineamiento de pares de secuencias (PWA) y alineamiento múltiple (MSA) Puntuación de alineamientos: matrices de sustitución y modelos de inserción y deleción Nivel de significación de los alineamientos Herramientas para la búsqueda de homología: BLAST, BLAT   Biología estructural y de sistemas Introducción a la biología estructural Herramientas de simulación molecular Predicción de estructura. Herramientas y utilidad Diseño de moléculas bioactivas. Farmacogenómica Reconocimiento e interacciones entre biomoléculas Introducción a la biología de sistemas Bases de datos metabólicos Simulación metabólica. Teoría del control metabólico. Metabolómica Redes de interacción entre biomoléculas     El trabajo del bioinformático
Bioinformatics, job description
Formación en bioinformática
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Online bioinformatics courses
Vídeos sobre Bioinformática Bioinformatics Career Overview Bioinformatics Insight Careers in Bioinformatics Introduction to Bioinformatics The central position of bioinformatics in Genomics
Ofertas de trabajo en bioinformática
An explosion of bioinformatics careers
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Oferta de trabajos en bioinformática (from the ISCB)
Percentage of alumni that enter into tenure-track positions based on their doctoral degree field - Nature Biotechnology 2018
Salarios con un máster en bioinformática en EEUU
Visualizing detailed postdoctoral employment trends using a new career outcome taxonomy. Nature biotechnology 2018 36:197-202

 

LESK, A.M. Introduction to bioinformatics. 4th ed. Oxford : Oxford University Press, 2014

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No se forman bioinformáticos al ritmo que crece su demanda, por lo que faltan expertos en los conocimientos y destrezas que se requieren para hacer bioinformática. Esta carencia de capacitación es un factor crítico que limita el avance de la investigación. Gran parte de los bioinformáticos de reciente formación han sido absorbidos por los principales centros de secuenciación mundial de modo que los pequeños laboratorios y centros de investigación pugnan por captar el escaso talento bioinformático disponible.

Además, muchas de las personas que desempeñan hoy en día tareas relacionadas con la bioinformática no disponen de titulaciones específicas. Esto frecuentemente se traduce en limitaciones en su capacidad de aportar las soluciones bioinformáticas más adecuadas y en un esfuerzo suplementario de formación para cumplimentar las carencias derivadas de la falta de una formación estandarizada.

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Enlace al software BioRender, que permite la creación de esquemas de los procesos celulares: https://biorender.com
● Buscador de artículos científicos: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov
● Buscador de artículos científicos: https://www.ncbi.nlm.nih.gov
● Buscador de artículos científicos: https://scholar.google.es
● Sociedad española de Biofísica: http://www.sbe.es/
● International Union for Pure and Applied Biophysics: http://iupab.org/